Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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