Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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