Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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