Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RPE65Q16518 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RPE65Q16518 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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