Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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GABRA6Q16445 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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