Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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