Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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