Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms