Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms