Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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