Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GAPVD1Q14C86 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
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