Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIN2CQ14957 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms