Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms