Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTTNQ14247 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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