Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
APOFQ13790 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOFQ13790 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOFQ13790 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOFQ13790 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOFQ13790 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOFQ13790 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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