Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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C1orf61Q13536 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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C1orf61Q13536 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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C1orf61Q13536 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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C1orf61Q13536 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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