Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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