Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms