Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF6Q13247 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF6Q13247 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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