Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME3Q13232 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NME3Q13232 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NME3Q13232 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms