Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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