Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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