Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms