Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms