Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FOXC1Q12948 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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FOXC1Q12948 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FOXC1Q12948 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FOXC1Q12948 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FOXC1Q12948 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FOXC1Q12948 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FOXC1Q12948 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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