Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF2Q12933 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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