Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
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