Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms