Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CGNL1Q0VF96 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms