Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD47Q08722 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms