Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC1Q08554 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms