Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms