Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms