Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms