Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms