Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms