Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms