Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms