Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLOD1Q02809 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms