Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms