Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms