Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms