Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HBBP68871 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms