Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms