Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms