Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP107P57740 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP107P57740 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms