Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AQP4P55087 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AQP4P55087 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms