Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATN1P54259 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATN1P54259 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATN1P54259 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATN1P54259 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATN1P54259 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATN1P54259 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATN1P54259 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATN1P54259 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATN1P54259 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATN1P54259 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATN1P54259 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATN1P54259 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATN1P54259 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATN1P54259 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATN1P54259 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATN1P54259 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATN1P54259 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATN1P54259 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATN1P54259 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATN1P54259 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATN1P54259 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATN1P54259 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATN1P54259 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATN1P54259 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms