Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF6P49848 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF6P49848 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF6P49848 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF6P49848 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF6P49848 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF6P49848 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF6P49848 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF6P49848 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF6P49848 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF6P49848 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF6P49848 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF6P49848 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF6P49848 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF6P49848 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF6P49848 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF6P49848 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF6P49848 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF6P49848 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms