Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms